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税制结构主要包括三个层次：第一个层次是不同税类的地位和相互关系。第二层次是同一税类内部和不同税类的各个税种之间的相互关系。第三个层次是各个税制要素之间的相互关系。
一、影响税制结构的因素生产力水平。
生产力水平的高低，直接决定着人均国民生产总值的高低。经济发展水平高，人均国民生产总值多，在满足社会成员的基本消费后，能有更多的剩余，为税收提供更充裕的来源。
经济结构。经济结构决定税源结构，从而决定税制结构。税制结构无法摆脱经济结构而存在，它只能建立在既定的经济结构之上，受既定的经济结构的影响。从产业结构来看，税收取自于社会财富，一个国家的产业结构如何，直接决定着税收的来源，从而影响着税种的设置和不同税种的地位。有什么样的产业才有什么样的税源，有了什么样的税源，才能根据这样的税源开征相应的税种。
政府调节经济的意图。不同的税收对经济具有不同的调节作用。政府调节经济的意图不同，税制结构是不同的。当政府有调整产业结构、调节收入分配、建立社会保障制度、保护环境等需要时，便开始征收具有该类调节功能的税收，税制结构趋于复杂。
税收征管水平。一定的税制结构要求与之相适应的征管水平，因为税制结构的预期目标要通过税收征管来实现；反过来，一定的税收征管水平会制约税制结构的选择。
历史原因。一个国家之所以采取这种而不是那种税制结构，除了受上述因素制约外，一些特殊的历史原因往往也起很大作用。比较典型的历史原因是战争。战争的爆发会产生巨大的财政需求，从而严重影响当事国的税制结构。为了应付战争需要，战时往往开征许多新税，一些旧有税种也会得到调整，从而造成税制结构的改变。
国际影响。在国际经济一体化的今天，一国经济不仅仅受本国税制的调节，还往往受到别国税制的影响。当别国调整税收制度，大肆减税时，本国若不采取相应行动则很可能导致投资外流，使本国产品成本过高，在国际竞争中处于劣势，影响本国经济的繁荣。
二、我国当前的税制结构
1.以商品劳务税为主体的税制模式
影响税制结构的因素按其改变的难易程度，可以分为两类：一类可在相对较短的时期内得到改变，如政府调节经济的意图、国际影响等；另一类在短期内改变的可能性则较小，如生产力水平、资源状况等。各个因素综合作用构成了一国既定的税制结构。短期内无法改变的因素基本上决定了税制结构，也就是税制模式的类型；短期内可以改变的因素只能在一定范围内影响税制结构，但无法改变税制模式。
税制模式的标志是主体税种，而主体税种的收入是受社会经济状况制约的。经济发达国家由于个人收入水平较高，个人收入之间的差异较大，从而决定了其税制结构中个人所得税的主体地位。对于发展中国家来说，人均收入水平低下、税源不足，个人所得税很难成为税制结构中的主体税种。所以说，税制模式的形成是客观的，无法选择。一国若要改变税制模式，必须首先改变影响本国税制模式的因素，这在短期内是无法做到的。我国的国情决定了我国只能是以商品劳务税为主体的税制模式。
2.提升个人所得税的地位首先，我国的国民收入分配格局发生了很大变化，国家、企业、个人收入占国内生产总值的比例已由1978年的3∶2∶5，变为1995年的1∶2∶7，1995年我国国内生产总值中个人收入达40258亿元。这说明，国民收入初次分配已经向个人倾斜，个人所得税的征收有了客观基础。其次，个人收入分配不公、差距悬殊现象随着个人收入的增加而出现，需要国家发挥个人所得税的作用进行调节。所以，尽快提升个人所得税的地位是我国目前税制结构调整的选择。