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产生变化传统的手工记账规则对总账、日记账所要进行订本账册的使用进行了规定，并且要求那些明细账必须要采用活页式的账册，通过很多套帐来实现账目之间的互相核对和互相牵制。账本记录、凭证所存在的错误必须要使用红字和划线的方法来对其进行一定的更正。在进行会计电算化以后，我们通常要使用计算机软件来进行账务的处理工作，只要我们所输入原始的凭证正确，计算机就能够迅速的完成我们在手工条件之下所进行的各种账务处理的功能。计算机已经在会计电算化的条件下将手工会计账册核对的功能进行了代替，那么，过去手工操作的内部控制措施在事业单位会计电算化以后就没有其存在的必须性和必要性了，这也在很大程度上将不相同职务监督的能力降低。
产生变化在传统的手工会计系统中，会计要将那些数据可以用到的符号、数字等直接在纸张上面进行记录，事业单位的每笔交易都必须要有相关的经办人员进行签字确定，甚至可以将不同笔迹作为控制的重要手段。但是，在事业单位会计电算化以后，传统会计工作的单据、凭证部分会消失不见，对其进行取代的就是那些将数据处理资料进行存储的光盘、磁带以及磁盘等等。而这些在磁性介质上进行存储的信息往往是我们人类肉眼不能够看到的，这样也就导致这些数据很容易被篡改或者删除，在这里消失、中断的传统控制程序以及传统的控制方法有些已经不能再适用了。
会计电算化要求我们现职责分离，也就是事业单位的资产保管、记录、执行以及业务授权等工作和职责要很好的分开。根据相关的会计电算化工作规范中所规定的内容，我们可以将事业单位会计电算化职责和岗位进行一定的划分，可以将其分为：数据分析，数据分析主要负责事业单位会计数据的分析工作；电算审查，主要负责事业单位会计工作的监督，以便很好的防止会计利用计算机进行作弊；审核记账，主要负责对于那些已经输入到计算机的事业单位会计数据进行一定的审核；软件操作，主要负责记账凭证以及原始凭证等会计数据的出入；电算主管，主要负责对会计软件系统运行工作和计算机运行工作的协调。
（一）将思想认识深度以及系统控制制度进行提升和规范
我们必须要对事业单位会计电算化将传统的会计数据领域、数据处理程序、数据存储形式以及会计核算方式进行了改变，并且将会计信息质量进行了提升，这在一定程度上方便和改变了事业单位进行经营决策以及财务分析等，不仅是会计技术和会计理论进一步的完善和发展，同时也对事业单位会计电算化内部控制制度改革进行了促进，成为了整个会计务实运用以及理论研究根本性的变革，动力就是思想，只有我们在思想方面认识到位，才能够将事业单位会计电算化的完善、发展以及推论文联盟www.lwlm.com整理广进行存进，对事业单位日常的操作管理控制工作进行完善，操作规程控制以及操作权限控制已经成为了系统操作控制的主要表现。其中，操作规程控制就是指在系统的操作过程中，我们必须要对一些标准操作的规程进行严格的遵循，将注意事项、操作程序以及职责进行明确，从而能够很好的形成一套事业单位自身会计电算化系统的文件‘所谓的操作权限控制就是指每一个岗位人员仅仅能够按照所授予权限来对系统进行自己的作业，岗位人员不能够将权限进行超越从而接触系统。
事业单位想要建立健全适合的职责分工制度和组织机构就必须要对相应岗位职责制度、权限划分、人员分工以及部门设置等方面进行完善，最为基本的目标就是进行制度的建立，从而形成一种相互制约、相互牵制的制度，这样能够减少和防止舞弊事件发生的几率。在事业单位中，基本的会计岗位主要包括：会计档案管理、稽核、会计核算、出纳以及会计主管等等工作岗位，而电算化会计的岗位主要包括：会计软件系统、维修计算机、操作计算机以及直接管理计算机等岗位。在进行机构的调整过程中，我们必须要将其与组织控制相互结合，从而实现了职权的分离，及时、有效的发现违法行为和错误。与此同时，我们还必须要建立健全职务轮岗制度。
自从事业单位进行会计电算化以后，要求事业单位必须要建立起计算机机房，为计算机的设备创造一个优秀、良好的运行环境，对机器设备进行保护，能够有效的防止其他的人员进入到计算机房，对数据和程序的安全进行保护。其中，系统维护工作主要包括软件维护以及硬件维护，系统硬件维护内容包括：对计算机进行定期杀毒、查毒；专机专用，财务操作的工作人员不能够在财务专用的计算机上面插入外来的光盘、软盘以及上网；及时的进行计算机故障分析，并且做好相应的记录；定期进行计算机的检查工作，并且做好相应的记录等等。还要对正在使用的计算机财务软件进行不定期或者定期的维护工作，这样能够防患于未然，能够确保计算机财务软件进行高校、平稳、安全的运行，并且对计算机财务软件所存在的不足不间断的进行修正，更加要对其所选用的计算基础财务软件进行及时的更新和升级。
事业单位只有建立起与会计电算化系统相互适应的事业单位内部会计控制制度，才能够将会计电算化系统的内部控制过程中不断出现的那些问题进行很好的解决，并且对事业单位的会计电算化工作向更加深入的层次进行发展。