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某县根据省人民政府批准，2009年度执行每月720元的最低工资标准，一吸收残疾人就业企业（符合税法规定享受税收优惠政策的各项条件）全年吸收残疾人就业平均人数为20人，支付工资总额168000元，平均每人每月700元，全年实现应纳增值税税额590000元（假定税款未缴纳，下同），企业因吸收残疾人就业申请退还增值税1036800元（即征即退，下同），经主管税务机关审核发现：企业申请退还的增值税数额虽然低于税法规定可按省级人民政府批准最低工资6倍的标准，但申请的退税额平均每个残疾人已达到51840元（1036800÷20＝51840），不但超过了每人每年35000元最高限额、计算基础超过实际发放平均工资20元（1036800÷6÷20÷12－700＝20），申请的退税总额也超过全年实际实现的增值税税款446800元（1036800－590000＝446800），因此，告知该企业只能申请退还增值税590000元。其计算依据和方法如下：
首先，确定法定应退还增值税的最高限额。
根据《财政部、国家税务总局关于促进残疾人就业税收优惠政策的通知》（财税[2007]92号）第一条第（一）项规定：企业实际安置每位残疾人每年可退还增值税的限额，可由县级以上税务机关根据单位所在区县（含县级市、旗）适用的经省（含自治区、直辖市、计划单列市）级人民政府批准的最低工资标准的6倍确定，但最高不得超过每人每年35000元。因此，该企业全年吸收20名残疾人就业可申请退还的增值税最高限额为35000×20＝700000元。
第二，确定在低于最低工资标准支付工资的情况下应退还增值税的最高限额。
根据财税[2007]92号文件第一条和第九条规定，确定吸收残疾人就业企业实际应退还的增值税税额除受每人每年不超过35000元的限制外，还受按低于最低工资标准支付工资实际支付额的限制，即：当按最低工资标准支付工资额的6倍超过35000元时按35000元确定应退还的最高限额，达不到35000元的按实际达到的数确定最高限额。该企业全年实际支付残疾人的工资总额为168000元，平均每人每月700元，低于省政府批准的最低工资标准20元，但全年平均的6倍为50400元（700×12×6＝50400），大于法定平均每人应退还的最高限额35000元，因此，该企业实际应退还的最高限额仍为700000元（35000×20＝700000）。假设该企业实际支付残疾人年平均工资的6倍小于35000元时，其实际应退还的最高限额就小于700000元了。
第三，确定在实现的增值税应纳税额低于按最低工资标准或低于最低工资标准实际支付额计算的扣除限额时实际应退还的增值税数额。
根据《国家税务总局、民政部、中国残疾人联合会关于促进残疾人就业税收优惠政策征管办法的通知》（国税发[2007]67号）第三条第（一）项规定，本年度应纳税额小于核定的年度退税限额的，以本年度应纳税额为限；本年度应纳税额不足退还的，不得结转以后年度退还。该企业全年实现应纳增值税税额590000元，小于按前述两种方法计算的扣除限额，因此，最终只能退还增值税590000元。
此外，在实际工作中除受上述扣除限额政策的约束外，根据财税[2007]92号文件和国税发[2007]67号文件的有关规定，吸收残疾人就业的企业单位今后在享受这一增值税退税政策时至少应注意两点：
一是实际安置残疾人占单位在职职工总数的平均比例在一个年度内累计三个月未达到要求时将取消次年度享受这一税收优惠政策的资格。
二是如果发现纳税人涉嫌采用签订虚假劳动合同或服务协议、伪造或重复使用残疾人证或残疾人挂名而不实际上岗工作、虚报残疾人安置比例、为残疾人不缴或少缴规定的社会保险、变相向残疾人收回支付的工资等方法骗取税收优惠政策或一证多用、虚构财税[2007]92号文件第五条规定的其他条件时，一经查证属实，其在发生违法违规行为年度内实际享受到的退税款全额追缴入库，在三年内取消享受这一税收优惠政策的资格，并按税收征管法的有关规定予以处罚。
对安置残疾人的单位，如何计算应退增值税税额？
一、根据《财政部 国家税务总局 关于促进残疾人就业税收优惠政策的通知》（财税[2007]92号）规定：“一、对安置残疾人单位的增值税和营业税政策对安置残疾人的单位，实行由税务机关按单位实际安置残疾人的人数，限额即征即退增值税或减征营业税的办法。……
（二）主管国税机关应按月退还增值税，本月已交增值税额不足退还的，可在本年度（指纳税年度）内以前月份已交增值税扣除已退增值税的余额中退还，仍不足退还的可结转本年度内以后月份退还。”
二、根据《国家税务总局 民政部 中国残疾人联合会关于促进残疾人就业税收优惠政策征管办法的通知》（国税发[2007]67号）第三条第一项规定：“增值税实行即征即退方式。主管税务机关对符合减免税条件的纳税人应当按月退还增值税，当月已缴增值税不足退还的，可在当年已缴增值税中退还，仍不足退还的可结转当年以后月份退还。当年应纳税额小于核定的年度退税限额的，以当年应纳税额为限;当年应纳税额大于核定的年度退税限额的，以核定的年度退税额为限。纳税人当年应纳税额不足退还的，不得结转以后年度退还。纳税人当月应退增值税额按以下公式计算：
当月应退增值税额=纳税人当月实际安置残疾人员人数×县级以上税务机关确定的每位残疾人员每年可退还增值税的具体限额÷12……缴纳增值税的纳税人应当在取得主管税务机关审批意见的次月起，随纳税申报一并书面申请退、减增值税。……”
新的安置残疾人企业或与残疾人事业有关的税收优惠政策，标红色字体的为政策主要内容，其他为辅助内容。
政策执行的依据是：《财政部、国家税务总局关于促进残疾人就业税收优惠政策的通知》（财税[2007]92号）
政策执行的时间：2007年7月1日起
一、对安置残疾人单位的增值税和营业税政策
对安置残疾人的单位，实行由税务机关按单位实际安置残疾人的人数，限额即征即退增值税或减征营业税的办法。
（一）实际安置的每位残疾人每年可退还的增值税或减征的营业税的具体限额，由县级以上税务机关根据单位所在区县（含县级市、旗，下同）适用的经省（含自治区、直辖市、计划单列市，下同）级人民政府批准的最低工资标准的6倍确定，但最高不得超过每人每年3.5万元。目前我省（云南省）各地最低工资标准的6倍均已超过3.5万元，因此，我省均按照每人每年3.5万元的最高限额标准执行。
（二）主管国税机关应按月退还增值税，本月已交增值税额不足退还的，可在本年度（指纳税年度，下同）内以前月份已交增值税扣除已退增值税的余额中退还，仍不足退还的可结转本年度内以后月份退还。主管地税机关应按月减征营业税，本月应缴营业税不足减征的，可结转本年度内以后月份减征，但不得从以前月份已交营业税中退还。
（三）上述增值税优惠政策仅适用于生产销售货物或提供加工、修理修配劳务取得的收入占增值税业务和营业税业务收入之和达到50%的单位，但不适用于上述单位生产销售消费税应税货物和直接销售外购货物（包括商品批发和零售）以及销售委托外单位加工的货物取得的收入。上述营业税优惠政策仅适用于提供“服务业”税目（广告业除外）取得的收入占增值税业务和营业税业务收入之和达到50%的单位，但不适用于上述单位提供广告业劳务以及不属于“服务业”税目的营业税应税劳务取得的收入。单位应当分别核算上述享受税收优惠政策和不得享受税收优惠政策业务的销售收入或营业收入，不能分别核算的，不得享受本通知规定的增值税或营业税优惠政策。
（四）兼营本通知规定享受增值税和营业税税收优惠政策业务的单位，可自行选择退还增值税或减征营业税，一经选定，一个年度内不得变更。
（五）如果既适用促进残疾人就业税收优惠政策，又适用下岗再就业、军转干部、随军家属等支持就业的税收优惠政策的，单位可选择适用最优惠的政策，但不能累加执行。
（六）本条所述“单位”是指税务登记为各类所有制企业（包括个人独资企业、合伙企业和个体经营户）、事业单位、社会团体和民办非企业单位。
二、对安置残疾人单位的企业所得税政策
（一）单位支付给残疾人的实际工资可在企业所得税前据实扣除，并可按支付给残疾人实际工资的100%加计扣除。
单位实际支付给残疾人的工资加计扣除部分，如大于本年度应纳税所得额的，可准予扣除其不超过应纳税所得额的部分，超过部分本年度和以后年度均不得扣除。亏损单位不适用上述工资加计扣除应纳税所得额的办法。
单位在执行上述工资加计扣除应纳税所得额办法的同时，可以享受其他企业所得税优惠政策。
（二）对单位按照第一条规定取得的增值税退税或营业税减税收入，免征企业所得税。
（三）本条所述“单位”是指税务登记为各类所有制企业（不包括个人独资企业、合伙企业和个体经营户）、事业单位、社会团体和民办非企业单位。
三、对残疾人个人就业的增值税和营业税政策
（一）根据《中华人民共和国营业税暂行条例》（国务院令第136号）第六条第（二）项和《中华人民共和国营业税暂行条例实施细则》〔[93]财法字第40号〕第二十六条的规定，对残疾人个人为社会提供的劳务免征营业税。（此政策一直都在执行）
（二）对残疾人个人提供的加工、修理修配劳务免征增值税。（此政策一直都在执行）
四、对残疾人个人就业的个人所得税政策
根据《中华人民共和国个人所得税法》（主席令第四十四号）第五条和《中华人民共和国个人所得税法实施条例》（国务院令第142号）第十六条的规定，对残疾人个人取得的劳动所得，按照省（不含计划单列市）人民政府规定的减征幅度和期限减征个人所得税。具体所得项目为：工资薪金所得、个体工商户的生产和经营所得、对企事业单位的承包和承租经营所得、劳务报酬所得、稿酬所得、特许权使用费所得。
五、残疾人用品优惠政策
（一）由残疾人组织直接进口供残疾人专用的物品，免征增值税。（此政策一直都在执行）
（二）供残疾人专用的假肢、轮椅、矫形器（包括上肢矫形器、下肢矫形器、脊椎侧弯矫形器），免征增值税。（此政策一直都在执行）
安置残疾人就业的单位（包括福利企业、盲人按摩机构、工疗机构和其他单位），同时符合以下条件并经过有关部门的认定后，均可申请享受本通知第一条和第二条规定的税收优惠政策：
（一）依法与安置的每位残疾人签订了一年以上（含一年）的劳动合同或服务协议，并且安置的每位残疾人在单位实际上岗工作。
（二）月平均实际安置的残疾人占单位在职职工总数的比例应高于25%（含25%），并且实际安置的残疾人人数多于10人（含10人）。
月平均实际安置的残疾人占单位在职职工总数的比例低于25%（不含25%）但高于1.5%（含1.5%），并且实际安置的残疾人人数多于5人（含5人）的单位，可以享受本通知第二条第（一）项规定的企业所得税优惠政策，但不得享受本通知第一条规定的增值税或营业税优惠政策。
（三）为安置的每位残疾人按月足额缴纳了单位所在区县人民政府根据国家政策规定的基本养老保险、基本医疗保险、失业保险和工伤保险等社会保险。
（四）通过银行等金融机构向安置的每位残疾人实际支付了不低于单位所在区县适用的经省级人民政府批准的最低工资标准的工资。
政策执行依据：《国家税务总局关于民政福利企业征收流转税问题的通知》（国税发[1994]155号）
政策执行时间：1994年1月1日起至2007年6月30日
一、由民政、街道和乡镇举办的社会福利企业（工业，不包括外商投资企业，安置“四残”人员占企业生产人员50％及以上的，增值税实行即征即退政策。
二、安置“四残”人员占企业生产人员35％以上，未达到50％的社会福利企业，如发生亏损，可给予部分或全部返还已征增值税照顾，具体比例的掌握以不亏损为限，返还办法是：企业应先按规定纳税，全年发生亏损的，年底向当地主管税务机关提出申请，由县级主管税务机关审批返还。
三、对特殊教育学校举办的企业可以比照福利企业的标准，享受国家对福利企业实行的增值税优惠政策。
四、安置的“四残”人员占企业生产人员35％及以上的民政福利企业，其经营属于营业税“服务业”税目范围内（广告业除外）的业务，免征营业税。
新旧政策的变化及对比
调整后的政策主要体现在以下四个方面：
一是扩大了可享受税收优惠政策的企业范围。为了给各类企业创造公平竞争的税收环境，鼓励更多的企业吸纳残疾人就业，政策调整后才享受税收优惠的安置残疾人就业企业，由现行的民政部门、街道和乡镇政府举办的国有、集体所有制福利企业，扩大到由社会各类投资主体设立的各类所有制企业。
二是扩大了鼓励安置就业的残疾人范围。为使具有劳动能力的各类残疾人享有同样的就业机会，调整后的政策将现行政策规定的“四残”（盲、聋、哑、肢体残疾）人员扩大到“六残”人员，新增加了智力残疾人和精神残疾人两类人员。
三是优化了鼓励残疾人就业的税收优惠方式。为堵塞现行民政福利企业税收政策存在的漏洞，便于税务部门加强征收管理，调整后的政策对享受税收优惠的企业安置残疾人员实行最低比例和绝对人数限制，具体比例为25%（含）以上，且安置人数不少于10人。
对达到上述安置比例的单位，在增值税和营业税方面，实行按企业实际安置残疾人员的人数限额退（减）税的办法。
在企业所得税方面，调整后的政策采取工资成本加计扣除的办法，并规定退减的流转税不再征收企业所得税。同时，为了与新企业所得税法和《残疾人就业条例》的有关规定衔接，更好地体现税收公平和支持残疾人就业的原则，对各单位超过安置义务（所谓安置义务，就是指《残疾人就业条例》规定，各单位必须安置1.5%（含）的残疾人员，否则要缴纳残疾人就业保障金）但低于25%，且残疾人员不少于5人的单位，可以享受企业所得税税前加计扣除的优惠政策，但不能享受流转税的优惠政策。
总体来看，调整后的税收优惠政策，基本保持了现行政策对企业安置残疾人就业的支持力度，在某些方面政策支持的力度还有所加大。同时，将企业享受税收优惠与所安置的残疾人人数挂钩、与残疾人工资挂钩，既有利于使优惠政策能够真正惠及到残疾人个人、又有利于避免现行政策中仅注重安置残疾人相对比例而不注重绝对数量的弊端。更为重要的是，新的税收优惠方式由于实行限额退（减）的办法，在一定程度上缓解了原来全额即征即退带来的问题，对于促进增值税制度的完善和规范、防止税收流失将起到积极作用。
四是突出了将保障残疾职工的合法权益作为享受税收优惠政策的重要条件。为保障残疾职工的合法权益，调整后的政策对单位享受税收优惠政策的条件，进行了严格规范。除了安置残疾人的比例、人数必须达到规定的条件外，还规定了其他四个与保障残疾职工的合法权益有着密切关系的条件：
1、企业必须依法与安置的每位残疾人员签订一年（含一年）以上的劳动合同或服务协议，并且安置的每位残疾人在单位实际上岗工作；
2、企业必须为安置的每位残疾人员按月足额缴纳所在县级人民政府规定的基本养老保险、基本医疗保险、失业保险和工伤保险等社会保险；
3、企业必须通过银行等金融机构向安置的每位残疾人员实际支付不低于企业所在县（市）适用的最低工资标准的工资；
4、企业必须具备安置残疾人员就业的基本设施和规章制度。这些条件的设置，既有利于加强税收政策的管理，防止企业弄虚作假的现象，又有利于运用税收引导的手段，强化企业对残疾人权益的保障，更好地体现了税收以人为本、关注民生的政策导向，对全社会维护残疾人的利益将起到有效的推动作用。
此次促进残疾人就业税收政策调整，是党中央、国务院坚持以人为本，推进社会主义和谐社会建设的一项重要政策措施。对进一步扩大残疾人就业，更好地维护残疾人合法权益促进广大残疾人员工作和生活条件的改善，将起到积极的推动作用。同时，政策的调整，特别是减免税方式的改变，还将有利于税制的规范和完善，对于健全增值税链条机制、堵塞多年来存在的税收政策漏洞，公平各类企业的税收待遇，都将起到重要的作用。