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目前，一般企业中的内部审计，从内容上讲主要是围绕信息的可靠性与完整性，政策、计划、程序、法律和规定的遵循，保护资本的安全，资源的节约和有效使用，经营目标的完成等方面来展开的。但内部审计从机构的设置、工作重点、审计内容的深度和广度、审计方式和规范管理等方面，还未发挥出应有的支持内部管理的作用，更无法适应现代企业建立健全内部控制制度的要求。
目前企业大部分的内部审计部门，基本上与其他职能部门平行，有些中小企业甚至还没有独立的内部审计部门，这样就无法保证内部审计的独立性和权威性。企业应在监事会下设审计部，审计部的设置需高于其他职能部门，审计部应对董事会负责，在业务上接受监事会的指导，这种双重负责的组织形式有利于内部审计作用的充分发挥。
(一)内部审计的职能要从查错防弊型向管理服务转变。一般企业的内部审计人员往往将大部分精力投入到财务数据的真实性、合法性的查证及生产经营的监督上，其主要职能是查错防弊而不是对企业管理做出分析、评价和做出管理建议，审计的对象主要是会计报表、账本、凭证及其相关资料，工作都集中在财务领域而未深入到管理和经营领域。随着企业内控制度的建立，外部约束机制的不断加强，内部管理的逐步提高，会计电算化的普及，账务表面的错弊会越来越少，内部审计也应从传统的防错向服务转变，内部审计的重点应从内部检查和监督向内部分析和评价转变。
(二)内部审计应从事后审计向事前审计和事中审计转变。目前。一般企业的内部审计都是事后审计，主要起监督作用。随着内部控制制度的建立，内部审计的作用将更多的体现在事前预防和事中控制。它将对企业内部控制进行全过程、全方位的监督和评价。内部审计应能及时发现各个环节存在的问题，把企业的风险降到最低程度。
(三)企业还应配备高素质的内部审计人才。随着内部审计由财务领域向经营、管理领域的拓展，审计机构在人员的构成上也应是多元化的，不仅要有懂财务的审计人才。而且还应配备精通法律、管理等相关业务的专门人才，选择有丰富业务经验的人员加入内部审计部门，使内部审计在企业内部控制制度中发挥更大的作用，更好地提高内部审计的质量和效率。
针对内控失效的现状，在重新建立健全内控制度时，就应有针对性地加强相关方面的内部审计工作。
(一)根据各部门的特点，建立管理全程递进式的监控措施。即在企业的生产经营一线，建立互相牵制、互相制约的内控制度，重要业务最好采用双签制，所以业务均要经过复核，禁止一个人处理业务的全过程，建立以“防”为主的监控防线。在会计部门常规性核算的基础上。内审部门对各个岗位、各项业务进行日常性和周期性的核查，建立以“堵”为主的监控防线。通过内部稽核、离任审计、落实举报、纪律检查、专项审计等手段，建立以“查”为主的监控防线。通过以上三个层次的内控措施，不仅可以及时发现问题，而且对于防范和化解企业的经营风险和会计风险。将起到重要的作用。
(二)加强内部考核的力度，使内部审计工作制度化。为了保证内部控制制度能有效地发挥作用。并使之不断地得到完善，企业就必须对内部控制制度的执行情况进行检查和考核，由内审部门结合财务部门、企业管理部门等职能部门来具体执行内部检查工作。检查内部控制制度是否得到有效遵循。对执行情况做出客观评价。并对于严格执行内部控制制度的，要给予精神鼓励或物质奖励。对于违规违章的，坚决给予行政处分和经济处罚，并与职务升迁挂钩。只有做到压力和动力相结合，才能最终达到内部控制的目的。
(三)建立内部审计的独立性和权威性，能对违法违规现象起到震撼作用。对内部审计中发现的问题，要分析出现违规现象的原因，如是属于主观原因的。要报请企业决策层，坚决予以查处，责令有关部门及时纠正：如属于制度设计缺陷的，要会同有关部门，及时对制度内容进行完善，以保证内控制度的先进性和权威性。在内部审计中如发现违法、违纪案件，要决不姑息手软，严肃追究相关人员的责任，并在企业内部给予通报。以起到警戒的作用。
(一)在企业内部建有独立的内部审计机构、完善的内部审计制度就是达到上述内部控制目标的重要途径。在科学的内部控制组织框架中，内审机构应必须是一个独立部门，它应直接对监事会负责，如有必要。遇有重大的内部审计事项或企业内部发生重大的违规、违法事件时，还可直接向股东大会及其常设机构董事会报告。在企业内部监督机制中，内审部门应有不可置疑的权威性，以保证内部审计报告能引起企业管理当局的足够重视。针对内审报告中提出的整改意见和处置建议，应及时予以研究并给予反馈，这样才能保证在科学、完善的决策、执行、监督机制下，最大力度地完成企业的经营目标。
(二)堵塞漏洞、消除隐患，防止并及时发现和纠正各种欺诈、舞弊行为，保护企业财产完整。也是内部控制所要达到的基本目标，同时这也是内部审计机构的基本职责。通过对企业经济业务活动的内部审计防微杜渐，及时发现管理中存在的漏洞和违法、违章的苗头。是内部审计人员在日常工作中的重点。
(三)规范企业会计行为，保证会计资料真实完整。提高会计信息质量，确保国家有关法律、法规和内部规章制度的贯彻执行，是内部控制的又一基本目标。内部审计在保证内部控制达到这一目标上更是大有可为。企业内部财务审计是内审的基本内容之一。内审是对企业会计资料真实完整的再监督，可及时发现会计工作中存在的不足、制度执行过程中出现的偏差，内部财务审计可以针对发现问题及时向企业管理当局提出建议，促使会计工作达到内控的要求和目标。